بررسی بیوانفورماتیک عملکرد ۱۲۴-mir بر روی فاکتورهای نسخه برداری دخیل در فرایند تمایز نورونی
نویسندگان
چکیده
زمینه و هدف: اگرچه ملکول 124-mir به عنوان یک القاکننده نوروژنز شناخته شده است، با این حال بررسی های انجام شده بر روی اهداف آن بسیار اندک است و مکانیسم های عملکرد آن در تمایز به سمت سلول های عصبی و نگهداری سلول های عصبی در حالت تمایز یافته ناشناخته می باشد. روش میکرواری به عنوان روش استاندارد برای مطالعه کلی ژن های تحت کنترل mirnaها مطرح است. با این حال هزینه بسیار زیاد این روش استفاده از آن را در اغلب مراکز علمی با محدودیت مواجه است. از سوی دیگر پیشرفت الگوریتم های بیوانفورماتیکی و سیستم های مدل سازی کامپیوتری منجر به توسعه نرم افزارهای بیوانفورماتیکی شده اند که توانایی پیش بینی اهداف mrna برای mi-rnaها را دارند. از این رو هدف این پژوهش تئوری بررسی بیوانفورماتیک اثر 124-mir بر روی فاکتور های نسخه برداری دخیل در فرآیند تکثیر سلولی و تمایز به سمت سلول های نورونی، با استفاده از نرم افزارهای مختلف و اختصاصی می باشد. مواد و روش ها: با استفاده از الگوریتم های مختلف موجود در پایگاه های تارگت اسکن، دایانا و میرواک، فاکتورهای نسخه برداری که هدف بالقوه عملکرد 124-mir بودند، مشخص شدند. سپس از ژن های کاندید شده براساس متغیرهایی همچون قدرت اتصال ناحیه هسته 124-mir و تعداد تکرار ناحیه هدف در قسمت ´3-utr فاکتور رونویسی یک جدول امتیاز تهیه شد. در نهایت فاکتور رونویسی دارای بالاترین امتیاز به عنوان کاندید بررسی های عملی انتخاب گشت. یافته ها: نتایج بررسی های بیوانفورماتیکی نشان داد که ملکول های lamc1، itgb1، ptbp1، sox9، sp1 و efnb1 با بیشترین احتمال ممکن است در مسیر نورون زایی تحت اثر 124-mir قرار گیرند. نتیجه گیری: به نظر می رسد که فاکتور نسخه برداری sp1 تحت کنترل 124-mir می باشد و نقش مهمی در فرآیند نوروژنز ایفا می کند. از این رو این پروتئین می تواند به عنوان کاندید جدید مناسبی جهت بررسی های تجربی در نظر گرفته شود.
منابع مشابه
تاثیر miR-146a و miR-150 بر القای تمایز سلول‌های لنفوئیدی T در سلول‌های بنیادی خونساز
چکید ه سابقه و هدف میکرو RNA ها، کلاسی از RNA های کوچک غیر کدکننده هستند و اخیراً نشان داده شده است که نقشی اساسی در فرآیندهای مهم سلولی از جمله تکامل و تمایز از طریق تنظیم پس از ترجمه، ایفا می‌کنند. نقش این عناصر در رده سلول‌های خونساز نیز بررسی شده است و شواهد زیادی دال بر دخالت میکرو RNA های شماره 150 ( miR-150 ) و 146 ( miR-146a ) در تمایز لنفوسیت‌های T وجود دارد. هدف از این مطالعه، بر...
متن کاملآسم آلرژیک و فاکتورهای نسخه برداری tbet, gata۳
آسم بیماری التهابی مزمن با مشخصه التهاب ائوزینوفیلی و انسداد راههای هوایی است. بیش از 300 میلیون نف ر در سراسر دنیا از این بیماری رنج برده و آمار آن در حال افزایش است. شایع ترین علائم این بیماری شامل خس خس سینه ، سرفه و تنگی نفس می باشد. بسیاری از مطالعات نشان داده اند که فعالیت سلول های t ( t cell ) می تواند با شدت آسم، درجه تنگی مجاری هوایی و پاسخ ائوزینوفیلی مرتبط باشد. درافراد اتوپیک مبتلا ...
متن کاملاحتمال اثرگذاری miR-93 miR-20a, و miR-20b در تمایز سلول‌های naïve CD4+ به سلول‌های Th17 در بیماری مالتیپل اسکلروزیس
چکید ه سابقه و هدف یکی از اساسی‌ترین سلول‌های سیستم ایمنی که در بیماری مولتیپل اسکلروزیس( MS ) دخالت دارد، سلول Th17 می‌باشد که در بسیاری دیگر از بیماری‌های خود ایمن نیز اثرگذار است. اخیراً از میکرو RNA ها در درمان بسیاری از بیماری‌ها استفاده می‌شود. miRNA ها دسته‌ای از RNA های غیر کد شونده به طول 22 تا 25 نوکلئوتید هستند که نقش‌های تنظیمی اساسی در فرآیندهای مختلف سلولی دارند. در این مطالع...
متن کاملهمراهی واریانت rs۵۳۱۵۶۴ در ژن hsa-mir-۱۲۴-۱ و دیابت تیپ ۲ در جمعیت ایرانی
زمینه و هدف : میکروrnaها (micrornas) تنظیم بیان ژن و فرآیندهای زیستی در بافت های مختلف را کنترل می کنند و نقش مهمی در بیماری های مختلف دارند. چندشکلی تک نوکلئوتیدی یا snpها در ژن های mirnas ها و یا جایگاه هایی روی mrna هدف، در پاتوژنز برخی از بیماری ها در انسان همراه است. این مطالعه به منظور تعیین ارتباط بین پلی مورفیسم mir-124 rs531564 g> c و استعداد ابتلا به دیابت در جمعیت ایرانی انجام شد. ر...
متن کاملهمانندسازی و نسخه برداری در ژنوم DNA میتوکندری
ژنوم میتوکندریایی DNAحلقوی دو رشته ای است. همانند سازی DNA میتوکندری با کمک آنزیم های اختصاصی درون میتوکندری و مستقل از هسته انجام می شود. یک سلول دارای هزاران نسخه از DNA دو رشته ای میتوکندریایی در ماتریکس داخلی میتوکندری است. در مرحله اول همانند سازی احتیاج به نسخه های کوچک RNA ای است که به کمک RNA پلی مرازهای میتوکندریایی تولید شده اند و می توانند پرایمر های ضروری در همانند سازیDNA میتوک...
متن کاملاثر مکمل سازی کراتین بر فاکتورهای دخیل در فرایند آپوپتوز (Bax، Bcl-2) و نسبت آنها در ورزش مقاومتی حاد مردان میانسال
زمینه و هدف: مکمل کراتین عمومی ترین مکمل است که جهت کمک ارگوژنیکی و نقش درمانی آن پیشنهاد شده است. هدف ما بررسی اثر مکمل سازی کراتین بر فاکتورهای آپوپتوزی Bcl-2، Bax و نسبت Bcl-2/Baxدر فعالیت مقاومتی حاد مردان میانسال بود. روش بررسی: در یک طرح کنترل شده-دارونما، دوسوکور، انتخاب تصادفی و همسان سازی شده، بیست و هفت مرد میانسال (43/5 ± 59/45 سال) بطور تصادفی به سه گروه با مصرف روزانه 20 گرم مونوه...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
عنوان ژورنال:
مجله دانشگاه علوم پزشکی اراکجلد ۱۷، شماره ۲، صفحات ۷۳-۸۱
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023